（1）凝膠成像：可以對蛋白質(zhì)凝膠，DNA凝膠，RNA凝膠樣品進行圖象采集，并可應用成像系統(tǒng)自帶軟件直接進行分析。樣品包括：EtBr、SYBR Green、SYBR Gold、Texas Red、GelStar、Fluoroscecin、 Radiant Red等染色的核酸凝膠；以及Coomassie Blue、SYPRO Orange、銀染的蛋白質(zhì)凝膠等。

 

（2）其他樣品成像：96孔板、培養(yǎng)皿等白光或自然光可激發(fā)的樣品成像。用成像系統(tǒng)成像由于焦距、光圈等參數(shù)可固定，圖像質(zhì)量更加均一，要優(yōu)于手持相機拍攝。

 

（3）半定量分析：根據(jù)分子量標準的分子量和濃度，可以對核酸或蛋白質(zhì)的分子量、濃度、相對含量等進行半定量分析。該分析主要是根據(jù)條帶的位置和條帶亮度與分子量標準的位置及亮度比對得到的結果，該結果要遠準確于肉眼的觀察和估計。另外，有些系統(tǒng)可進行遺傳樹分析和VNTRs等分析（如北京賽智ChampGel, SmartGel凝膠成像系統(tǒng)），可以便于在遺傳學水平上進行分析。

 

（4）菌落計數(shù)分析：可以對培養(yǎng)皿上的菌落進行計數(shù)，可以降低手動計數(shù)帶來的誤差。

 

（5）點雜交分析：微孔板或膜上的雜交反應進行定性和半定量分析，可以根據(jù)閾值分辨出陰性和陽性雜交，并計算出濃度值。

 

（6）測量分析：對樣品的長度進行測量，適用于生物樣本的長度測量，抗生素效價的計算等。